A partir do Anime do Mega Man Maverick Hunter X - Sigma
Motivo de deixar: traiu os humanos e os Reploids, ficou infectado com Zero Virus e tornou-se líder da organização criminosa chamada Mavericks, com o objectivo de aniquilar a humanidade e criar uma nação onde só Reploids existem. Zero assumiu o seu lugar.
A partir do Mega Man X - Zero
Motivo de deixar: Morreu em batalha ao se autodestruir para eliminar a Ride Armor do Vile. Mega Man X assumiu o seu lugar.
A partir do Mega Man X2 - Mega Man X
Motivo de deixar: X cresceu, derrotou o Sigma, mas ainda se deixa ser enganado por outros ao levá-lo a ser raptado pelo Mac do exército do Dr. Doppler. Dr. Cain assumiu o seu lugar.
A partir do Mega Man X3 (SNES) e Mega Man Maverick Hunter X - Dr. Cain
Motivo de deixar: desde que X se deixa ser enganado pelos outros, ficou a cargo de mandar os Maverick Hunters eliminar Sigma e todos os Mavericks. Deixou o cargo devido a ele se deixar ser enganado pelo Sigma ao fazê-lo acusar falsamente a Repliforce de destruir a cidade flutuante Sky Lagoon e m4t4r humanos e Reploids. Signas assumiu o seu lugar.
A partir do Mega Man X5 até ao Mega Man X8 - Signas
Signas é um supercomputador com uma inteligência quântica. Signas acalma o X constantemente quando se sente exaltado e é considerado o melhor líder dos Maverick Hunters. Foi ele que liderou a missão de eliminar a origem do Sigma Virus que iria afectar a Eurasia se não fosse o Zero a disparar o Enigma para eliminar o objecto nocivo do espaço. Não se sabe o seu fim que levou aos acontecimentos do Mega Man Zero.