Iron Man e Vision foram derrotados e raptados pelo Mandarin, a mando do Red Skull. Mandarin ameaça os Vingadores de viajarem para Avengers Park para resgatarem o Iron Man e Vision para se entregarem e deixá-los sofrer pelo Mandarin. Captain America e Hawkeye têm de resgatar 599 Power Stones cada um para aumentarem os seus poderes até ao máximo e viajarem por toda a América para derrotar Red Skull e salvar o seu país.
Tu começas com 2 corações de vida. Cada 100 Power Stones, tu aumentas 1 coração até o máximo de 5. Depois de acumulares 500 Power Stones, tens de encontrar um coração para restaurares a tua vida até ao máximo. Se ficares ferido durante o nível, a tua vida não é recuperada até achares os corações para restaurares a vida do Capitão América ou do Hawkeye no próximo nível que tu jogares. Em cada nível, tens de achar uma esfera brilhante com as cores vermelha e branca que te apresenta o EXIT, que é a saída que tens de ir para completares o nível cada vez que visitas ou revisitas o local. O mesmo dá para o farming de Power Stones para aumentares o teu poder no máximo com as duas personagens, independentemente que as juntas ou jogues cada uma separada.
Mesmo ao completar o nível, o nível não foi totalmente completo, porque em alguns níveis, tu tens de enfrentar inimigos mais fortes ao longo do caminho. Se pisares num remoinho negro, estás na base do inimigo ao gatilhar o Red Alert, obrigando-te a enfrentar inimigos inesperados. Pode ser uma horda de soldados comuns que disparam balas com a sua shotgun. Pode ser um guerreiro que atira o barril de cerveja materializado por ele ou pode ser este mesmo guerreiro que assuma a sua forma verdadeira, que dispara chamas pelo seu lançador de chamas. Afasta-te o máximo possível para atacares o inimigo em longa distância porque o lançador de fogo fica a arder e se te toca, o dano que sofres é massivo e podes até m0rr3r. Se m0rr3r3s, vais recomeçar do nível que começaste e anula-se os inimigos que eliminaste nesse nível.
Se perderes e só jogares com Captain America ou com o Hawkeye; ou se deixares ambos os Vingadores m0rr3r3m, tu és obrigado a inserir um Continue para continuares a jogar dentro da contagem de 10 segundos. Se não inserires um Continue, o jogo acaba e começas tudo de início. Se continuares, podes manter-te no mesmo nível que completaste da última vez. Mesmo que deixes o Captain America ou o Hawkeye m0rr3r, tens uma zona secreta onde podes pegar um item essencial para o ressuscitares, fazendo com que essa personagem ressuscitada mantém o mesmo poder que tinha antes de ser derrotado em batalha. Se apanhares um H, é para ressuscitares Hawkeye e fazer com ele ele se junte a ti. Se apanhares um A, é para ressuscitares o Captain America e fazer com que se junte a ti. Tens de juntar o Hawkeye com o Captain America, derrotar todos os chefes dos Estados Unidos e apanhar a Quinjet em Las Vegas para te dirigires a Houston e viajares até à Lua para resgatares Iron Man e Vision e enfrentar Crossbones e Red Skull como chefes finais. Mesmo que percas os Vingadores em batalha e gastes um Continue, tu manténs a Quinjet. Só tens de te reunir e ressuscitar o Vingador falecido para viajarem juntos até à Lua e enfrentar Red Skull no final.
As mecânicas do Captain America são as seguintes:
Para executares o Running Tackle, prime duas vezes para à frente. Isso faz com que Captain America empurre o seu adversário e lhe cause um enorme dano. É útil para passares nos portões que tenham ondas magnéticas que causam m0rt3 instantânea se não passares com cuidado.
Para executares o Shield Slash, prime uma vez no botão de ataque. Captain America atira o disco para à frente, mas a partir de 300 Power Stones ou mais, o escudo do Captain America avança, recua e depois devolve até ele. Útil para enfrentar Red Skull e Crossbones.
Captain America pode saltar e se segurar nas varandas. Tens se segurar o botão de salto para te segurares. Para te largares, pressiona qualquer direcção e saltas ao premir no botão de salto. Captain America também tem a vantagem que ao mesmo tempo que ele salta, ele manda pontapés no ar, mas isso causa dano mínimo.
As mecânicas do Hawkeye são as seguintes:
Hawkeye tem a vantagem de mirar de forma diagonal superior ou horizontal. Nunca atira em vertical. Os disparos diagonais superiores, seja para a esquerda ou para a direita facilita o combate com Mandarin no Avengers Park.
Hawkeye dispara com a seta com potência mais baixa, mas a partir de 300 Power Stones, o poder da seta aumenta dramáticamente até ao poder máximo.
Hawkeye não corre, não chuta e não se segura nas varandas. Hawkeye só é útil para determinadas situações e batalhas que só ele tem vantagem.
As causas da m0rt3 afectam no jogador e obriga a usar Continues para continuar no jogo ou começar o jogo de novo. Lembra-te que não tem contador de vidas então só tens uma vida para cada personagem. As causas da m0rt3 apontam como:
1- Toque directo com o inimgo
2- Se calcar nos espinhos
3- Se for atingido por balas
4- Se for atingido por barril de cerveja materializado
5- Se tocar nas chamas do lançador de chamas
6- Se for chutado pelo Red Skull
7- Se for atingido por disparos de energia das mãos de certos inimigos
8- Se for atingido por um portal com ondas magnéticas que causam m0rt3 imediata
9- Se cair nas chamas no nível da Philadelphia
10- Se tocar no ácido
11- Se afogar na água na luta com o Ultron
12- Se Crossbones, Ultron e Wizard forem atingidos pelo Shield Slash, Running Tackle ou pontapé aéreo do Capitão América (modo Versus)
13- Se Crossbones, Ultron e Wizard forem atingidos pela seta do Hawkeye (modo Versus)
14- Se Crossbones usar Extreme Speed para empurrar (modo Versus e modo 1P)
15- Se Ultron acertar com bolas de energia (modo Versus e modo 1P)
16- Se Wizard acertar com as suas balas de energia ou o seu raio de energia (modo Versus e modo 1P)
17- Tecto a cair em cima nos níveis nas lutas contra Crossbones
18- Se for atingido pelos relâmpagos do Mandarin no Avengers Park
19- Se for atingido pelo Elbow Extreeme Speed do Red Skull
20- Se for atingido pelo pontapé voador do Red Skull
21- Se for atingido pelas bolas de energia disparadas pela Quinjet depois do Crossbones esmurrar o vidro para poder invadir e atacar os Vingadores.
Cada inimigo tem uma quantidade de vida maior que o outro dependendo de quantas vezes acertas no adversário até o eliminar. Na batalha contra os chefes, a música toca quando enfrentas um chefe mas a música muda para o tema do Captain America ou do Hawkeye, dependendo de quem jogares com ele quando estás quase a acabar com o chefe.
Se terminares o jogo, independentemente com quem jogues, Captain America ou Hawkeye, o jogo acaba e o mérito fica maior parte para o Captain America.
O jogo diz Continue no fim, querendo dizer que Captain America and The Avengers ia ter continuação pela Data East, só que a empresa faliu nos anos 1990 do Século XX.
Captain America and The Avengers é a conclusão da história do jogo com o mesmo nome lançado para NES, A história começou com a versão das Arcadas, SNES e SEGA Mega Drive, mas depois que Red Skull foi derrotado, ele foge e retoma os seus crimes na versão da NES.
