Cyborg 009 Nemesis será o Anime a adaptar os eventos do Manga do Cyborg 009. A saga Nemesis trata-se de uma organização da nova ordem mundial, o Black Ghost, que capturou e modificou 9 humanos para se tornarem nos novos ciborgues de combate, conhecidos como Nemesis. Os ciborgues criados por  Isaac Gilmore têm de lutar e matar os ciborgues dos Nemesis para parar a guerra e parar a nova ordem mundial para restaurar a paz. O Cyborg 009 terá a abertura escrita com letras compostas pelo autor do Manga, Ishinomori. O guionista Atsuhiro Tomioka, o mesmo guionista do Anime Pokémon, também está a trabalhar neste Anime do Cyborg 009 Nemesis.