O jogo base terá 531 Pokémon. Nas fugas passadas, mencionadas pela Centro Leaks, 300 novos Pokémon estão disponíveis no Winds e Waves. De acordo com o Pokémon Universe, são 531 Pokémon no jogo base mas mais de 400 Pokémon aparecerão como DLCs. Estima-se que 400 Pokémon em 2 DLCs regressam na Nintendo Switch 2, o que dá 1325 Pokémon que são compatíveis (toda a National Pokédex), para se redimir dos problemas que os jogos Pokémon da Nintendo Switch trouxeram para os consumidores. Lembrando que nem todos os Pokémon são compatíveis na versão actual do Pokémon Champions mas serão adicionados no futuro para dar tempo ao desenvolvimento do MMORPG do Pokémon e também o novo jogo da série Legends sobre a região de Galar.

7 Pokémon terão novas formas evolutivas dos Pokémon antigos.
Para compensar a redução das formas regionais de Paldea para 4, Winds e Waves trará uma nova região com 16 formas regionais.
Haverão 31 Pokémon com formas Netsu, que são Pokémon que alteram as suas formas correspondentes às condições especiais do tempo em batalhas.